Los organismos nacionales INTA e INTI se encuentran trabajando en la actualidad con programas y proyectos para agroindustrias en la provincia de San Juan.
En este contexto la Secretaría de Ambiente y Desarrollo Sustentable brinda asesoramiento técnico, a través de especialistas de la Dirección de Gestión Ambiental, sobre la reutilización que deberá realizar cada industria con los residuos generados, según la actividad que desarrolla cada una.
La Secretaría de Ambiente es el órgano encargado de la fiscalización de las actividades de estas industrias, para lograr el cumplimiento de la legislación ambiental vigente, exige entre otros requerimiento la Declaración de Impacto Ambiental, a través de la cual se exige un adecuado manejo de los residuos.